RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 GPC1P35052 558 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 CENPCQ03188 943 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 RNF135Q8IUD6 432 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 RRAGCQ9HB90 399 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-211ENST00000504624 IL2RAP01589 272 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 SEMA3FQ13275 785 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CLN3Q13286 438 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 DBN1Q16643 649 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC125Q86Z20 511 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CNKSR1Q969H4 720 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 AMPD1P23109 780 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 MAP2K3P46734 347 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 XP32Q5T750 250 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF15Q8N660 670 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF592Q92610 1267 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ACDQ96AP0 544 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 PHF24Q9UPV7 400 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 POM121CA8CG34 1229 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 F11P03951 625 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 USP4Q13107 963 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 WASHC4Q2M389 1173 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 PGBD3Q8N328 593 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 PIK3R2O00459 728 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GNRH1P01148 92 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CLUAP1Q96AJ1 413 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 XAGE2Q96GT9 111 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GPAMQ9HCL2 828 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 OIP5O43482 229 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 SKIP12755 728 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GNASQ5JWF2 1037 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ALG2Q9H553 416 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 RAD21O60216 631 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 PROCP04070 461 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 BMP4P12644 408 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 BAG6P46379 1132 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 GRIN2CQ14957 1233 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 WDR44Q5JSH3 913 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-211ENST00000504624 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 SCNN1DP51172 638 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 GDF10P55107 478 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 C4orf17Q53FE4 359 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 EFHC2Q5JST6 749 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.9□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 A0A1B0GTH6 734 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 THBS1P07996 1170 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 FURINP09958 794 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 TLR1Q15399 786 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 AIDAQ96BJ3 306 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 RUBCNLQ9H714 662 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 USP3Q9Y6I4 520 aa4.89□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 KRBA1A5PL33 1030 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 ITGB2P05107 769 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 INHAP05111 366 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 MSX1P28360 303 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 FLIIQ13045 1269 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 MAP7D1Q3KQU3 841 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 ESCO1Q5FWF5 840 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 KLRG1Q96E93 195 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 SOX11P35716 441 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 PLA2G4AP47712 749 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 PSME1Q06323 249 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-211ENST00000504624 NCOA4Q13772 614 aa4.87□□□□□ -1.63
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