RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC125Q86Z20 511 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT12Q8IYM1 358 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 SLIT2O94813 1529 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 GLI3P10071 1580 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRCP08575 1304 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS72Q15906 364 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC4A2P04920 1241 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 LGR6Q9HBX8 967 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 G2E3Q7L622 706 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 COL18A1P39060 1754 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ERBB3P21860 1342 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 NUCB1Q02818 461 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 BTG4Q9NY30 223 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CPDO75976 1380 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC6O95255 1503 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 GCC1Q96CN9 775 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-209ENST00000504450 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXB7P09629 217 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM182BQ5T319 152 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ANP32EQ9BTT0 268 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 STK31Q9BXU1 1019 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA3Q99758 1704 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 RGPD5Q99666 1765 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNQ3O43525 872 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 BAG6P46379 1132 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 CHD1LQ86WJ1 897 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 DCTPP1Q9H773 170 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP10DQ9P241 1426 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC24BO95487 1268 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 FLIIQ13045 1269 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 EP400Q96L91 3159 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 TEFQ10587 303 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP85Q6P2H3 762 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 MEIS3Q99687 375 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 STRN4Q9NRL3 753 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 BTBD11A6QL63 1104 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 F6X3S4 739 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNA2Q15822 529 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD45Q5TZF3 282 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 LNPKQ9C0E8 428 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNA1FO60840 1977 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 MEGF6O75095 1541 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms