RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 TOMM70O94826 608 aa14.78□□□□□ -0.04
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CD27-AS1-204ENST00000504270 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.66□□□□□ -0.06
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CD27-AS1-204ENST00000504270 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.64□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPG7Q9UQ90 795 aa14.64□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.63□□□□□ -0.07
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CD27-AS1-204ENST00000504270 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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CD27-AS1-204ENST00000504270 RNF181Q9P0P0 153 aa14.61□□□□□ -0.07
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CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.61□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.61□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.59□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATG3Q9NT62 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCAPD2Q15021 1401 aa14.58□□□□□ -0.07
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEFMP07197 916 aa14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNA3P22001 575 aa14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.58□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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CD27-AS1-204ENST00000504270 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CD27-AS1-204ENST00000504270 GYS1P13807 737 aa14.57□□□□□ -0.08
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