RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.66■□□□□ 0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 CAPN15O75808 1086 aa17.65■□□□□ 0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 NFE2L2Q16236 605 aa17.65■□□□□ 0.42
PGGT1B-204ENST00000503638 PROM2Q8N271 834 aa17.65■□□□□ 0.42
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PGGT1B-204ENST00000503638 LY75O60449 1722 aa17.43■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 PAPPAQ13219 1627 aa17.43■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 GNAI1P63096 354 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 NGEFQ8N5V2 710 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 AK7Q96M32 723 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-204ENST00000503638 MTFR1LQ9H019 292 aa17.42■□□□□ 0.38
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PGGT1B-204ENST00000503638 IFT57Q9NWB7 429 aa17.41■□□□□ 0.38
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