RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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HOXD11-202ENST00000498438 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD11-202ENST00000498438 AK7Q96M32 723 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD11-202ENST00000498438 MSH5O43196 834 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-202ENST00000498438 ITPK1Q13572 414 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-202ENST00000498438 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.71■■□□□ 1.55
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HOXD11-202ENST00000498438 MRC1P22897 1456 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD11-202ENST00000498438 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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HOXD11-202ENST00000498438 LGR6Q9HBX8 967 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD11-202ENST00000498438 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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HOXD11-202ENST00000498438 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.65■■□□□ 1.54
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HOXD11-202ENST00000498438 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.64■■□□□ 1.54
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HOXD11-202ENST00000498438 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
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HOXD11-202ENST00000498438 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.61■■□□□ 1.53
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HOXD11-202ENST00000498438 FCHSD2O94868 740 aa24.57■■□□□ 1.52
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HOXD11-202ENST00000498438 KLHL34Q8N239 644 aa24.57■■□□□ 1.52
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HOXD11-202ENST00000498438 ADRA2BP18089 450 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD11-202ENST00000498438 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXD11-202ENST00000498438 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.46■■□□□ 1.51
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HOXD11-202ENST00000498438 ZNF790Q6PG37 636 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-202ENST00000498438 MCM10Q7L590 875 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-202ENST00000498438 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.46■■□□□ 1.51
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HOXD11-202ENST00000498438 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD11-202ENST00000498438 BTBD11A6QL63 1104 aa24.42■■□□□ 1.5
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HOXD11-202ENST00000498438 GYS1P13807 737 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXD11-202ENST00000498438 DCTN1Q14203 1278 aa24.42■■□□□ 1.5
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HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.41■■□□□ 1.5
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HOXD11-202ENST00000498438 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
HOXD11-202ENST00000498438 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD11-202ENST00000498438 KCNQ3O43525 872 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD11-202ENST00000498438 GPR162Q16538 588 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD11-202ENST00000498438 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD11-202ENST00000498438 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXD11-202ENST00000498438 NFE2L2Q16236 605 aa24.38■■□□□ 1.49
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