RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR1H3Q13133 447 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF20Q5VTR2 975 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PODNQ7Z5L7 613 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.97□□□□□ -0.81
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APBB1O00213 710 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL8A1P27658 744 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLRG1Q96E93 195 aa9.96□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP2K3P46734 347 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CENPCQ03188 943 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNKSR1Q969H4 720 aa9.94□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2CD2LO14523 706 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNRH1P01148 92 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLIIQ13045 1269 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPAMQ9HCL2 828 aa9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHKA2P46019 1235 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XAGE2Q96GT9 111 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF5Q13568 498 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAG6P46379 1132 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf17Q53FE4 359 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GTH6 734 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COG6Q9Y2V7 657 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POM121Q96HA1 1249 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RUBCNLQ9H714 662 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HCN2Q9UL51 889 aa9.88□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSX1P28360 303 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.87□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BNIP3LO60238 219 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABL2P42684 1182 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTBSQ01459 385 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF24Q9UPV7 400 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FURINP09958 794 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF592Q92610 1267 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGA1Q9UJY5 639 aa9.82□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGFR3P22607 806 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGB7P26010 798 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNASQ5JWF2 1037 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPXP11678 715 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP4P12644 408 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DGKGP49619 791 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAC14Q08AM6 782 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q8N3U1 123 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD6Q96KE9 485 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRAGCQ9HB90 399 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAD21O60216 631 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WASHC4Q2M389 1173 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLF15Q9UIH9 416 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP4AP20648 1035 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCNN1DP51172 638 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIN2CQ14957 1233 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD163Q86VB7 1156 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGBD3Q8N328 593 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRNA4P43681 627 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms