RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495131.1

GBP1-208, Transcript of guanylate binding protein 1, human

TSL 2

Gene GBP1, Length 748 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GBP1-208	ENST00000495131	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.16	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	MTFR1	Q15390	333 aa		10.15	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	TLR1	Q15399	786 aa		10.15	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
GBP1-208	ENST00000495131	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	SMTN	P53814	917 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	THBS1	P07996	1170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	CLDN10	P78369	228 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	DBN1	Q16643	649 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	CDC14C	A4D256	554 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	DKK1	O94907	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	PHKA2	P46019	1235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	EPHA4	P54764	986 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131		A0A1B0GTH6	734 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131		A6NJY4	79 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	F11	P03951	625 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	GAS6	Q14393	721 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GBP1-208	ENST00000495131	FOXK2	Q01167	660 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131		H7C1W4	665 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	ATP1A2	P50993	1020 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	SIX5	Q8N196	739 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	BACH1	O14867	736 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	MSX1	P28360	303 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	PSME1	Q06323	249 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	ATP4A	P20648	1035 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131		M0R2N6	131 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	GPR25	O00155	361 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GBP1-208	ENST00000495131	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	RASA1	P20936	1047 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	PTK7	Q13308	1070 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	TEAD4	Q15561	434 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	SFI1	A8K8P3	1242 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GBP1-208	ENST00000495131	MBIP	Q9NS73	344 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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