RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP6V1AP38606 617 aa30.89■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ITPK1Q13572 414 aa30.89■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 MORC1Q86VD1 984 aa30.89■■■□□ 2.54
TRDMT1-211ENST00000495022 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF5Q96JK2 942 aa30.88■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 KDRP35968 1356 aa30.88■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.86■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 GNPATO15228 680 aa30.85■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM5Q71RC9 77 aa30.85■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.85■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN11AQ9UI33 1791 aa30.81■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF13BQ9NQT8 1826 aa30.81■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.79■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 C1QTNF8P60827 252 aa30.79■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.78■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CABP4P57796 275 aa30.77■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.77■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.76■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 C4AP0C0L4 1744 aa30.75■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 IL13P35225 146 aa30.75■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MTHFSP49914 203 aa30.75■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa30.75■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ADRA2BP18089 450 aa30.74■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.74■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAPPC3LQ5T215 181 aa30.74■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa30.71■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MMP10P09238 476 aa30.71■■■□□ 2.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TJP1Q07157 1748 aa30.7■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NLGN1Q8N2Q7 840 aa30.69■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS6KA4O75676 772 aa30.68■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.67■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
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TRDMT1-211ENST00000495022 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.66■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ADCY9O60503 1353 aa30.66■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 AKAP4Q5JQC9 854 aa30.65■■■□□ 2.5
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TRDMT1-211ENST00000495022 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.64■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 RFC4P35249 363 aa30.64■■■□□ 2.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP350Q5VT06 3117 aa30.63■■■□□ 2.49
TRDMT1-211ENST00000495022 C10orf71Q711Q0 1435 aa30.63■■■□□ 2.49
TRDMT1-211ENST00000495022 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
TRDMT1-211ENST00000495022 GYS1P13807 737 aa30.63■■■□□ 2.49
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TRDMT1-211ENST00000495022 SLC52A2Q9HAB3 445 aa30.58■■■□□ 2.49
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC87Q9NVE4 849 aa30.58■■■□□ 2.49
TRDMT1-211ENST00000495022 HMOX1P09601 288 aa30.56■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 PARP3Q9Y6F1 533 aa30.56■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.56■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa30.56■■■□□ 2.48
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TRDMT1-211ENST00000495022 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 LGR6Q9HBX8 967 aa30.54■■■□□ 2.48
TRDMT1-211ENST00000495022 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
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TRDMT1-211ENST00000495022 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
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TRDMT1-211ENST00000495022 KCPQ6ZWJ8 1503 aa30.51■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
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TRDMT1-211ENST00000495022 DPEP1P16444 411 aa30.48■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP8Q14318 412 aa30.47■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC39A6Q13433 755 aa30.46■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
TRDMT1-211ENST00000495022 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DDR1Q08345 913 aa30.44■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 VSIG10Q8N0Z9 540 aa30.43■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ZPR1O75312 459 aa30.42■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FCHSD2O94868 740 aa30.42■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNA3P22001 575 aa30.42■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TM4SF1P30408 202 aa30.41■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 COL15A1P39059 1388 aa30.4■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.4■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PIM2Q9P1W9 311 aa30.4■■■□□ 2.46
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