RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	MAP2K3	P46734	347 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTC3-222	ENST00000491952	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
TTC3-222	ENST00000491952	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
TTC3-222	ENST00000491952	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTC3-222	ENST00000491952	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTC3-222	ENST00000491952	ADAM23	O75077	832 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	IL27	Q8NEV9	243 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1B0GTH6	734 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	C2CD2L	O14523	706 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	COL8A1	P27658	744 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	MSX1	P28360	303 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	IRF5	Q13568	498 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTC3-222	ENST00000491952	BNIP3L	O60238	219 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	PHKA2	P46019	1235 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	XP32	Q5T750	250 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	APBB1	O00213	710 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	SCNN1D	P51172	638 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	CTBS	Q01459	385 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	USP4	Q13107	963 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	EPX	P11678	715 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	ATP4A	P20648	1035 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	BAG6	P46379	1132 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	ARAF	P10398	606 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	FGFR3	P22607	806 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTC3-222	ENST00000491952	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	DGKG	P49619	791 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	INHA	P05111	366 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	BMP4	P12644	408 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	TLR1	Q15399	786 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	MTFR1	Q15390	333 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	TNP2	Q05952	138 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	MDFI	Q99750	246 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	GNB5	O14775	395 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	SMTN	P53814	917 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	GDF10	P55107	478 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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