RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 TNS4Q8IZW8 715 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 SERTAD1Q9UHV2 236 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 NNTQ13423 1086 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 ICMTO60725 284 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.05□□□□□ -0.32
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PTPRC-212ENST00000491302 GLYCTKQ8IVS8 523 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 A6NJY4 79 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 ADH1AP07327 375 aa13.03□□□□□ -0.32
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PTPRC-212ENST00000491302 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
PTPRC-212ENST00000491302 FOXC1Q12948 553 aa13.03□□□□□ -0.32
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PTPRC-212ENST00000491302 H3BRB1 525 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 C21orf2O43822 256 aa13.02□□□□□ -0.33
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PTPRC-212ENST00000491302 MTFR1Q15390 333 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT3Q9UH03 358 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JS52 829 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PRKD2Q9BZL6 878 aa13□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 FOXK2Q01167 660 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF15Q8N660 670 aa12.99□□□□□ -0.33
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PTPRC-212ENST00000491302 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
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PTPRC-212ENST00000491302 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CDK2AP1O14519 115 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZVU0 165 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 HELQQ8TDG4 1101 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 IL2RAP01589 272 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CLN3Q13286 438 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 TLR1Q15399 786 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4X1Q8N118 509 aa12.97□□□□□ -0.33
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PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRU2 124 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 PTGIRP43119 386 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 ITPKCQ96DU7 683 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP3Q96P20 1036 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 FAM13AO94988 1023 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 CBLBQ13191 982 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf46Q6P387 395 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 HRH3Q9Y5N1 445 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 GDF9O60383 454 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 E9PSI1 815 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 J3QL48 77 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 NPR3P17342 541 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 TBCELQ5QJ74 424 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 MEN1O00255 615 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 CENPCQ03188 943 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR3Q13615 1198 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-212ENST00000491302 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 SERTM1A2A2V5 107 aa12.89□□□□□ -0.35
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PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP4P98171 946 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 RELBQ01201 579 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ECM1Q16610 540 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 POTEAQ6S8J7 498 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF428Q96B54 188 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD33BA6NCL7 494 aa12.87□□□□□ -0.35
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