RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
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HOXB3-211ENST00000490677 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
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HOXB3-211ENST00000490677 YY1P25490 414 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 MSH5O43196 834 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 SMIM5Q71RC9 77 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 FLAD1Q8NFF5 587 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-211ENST00000490677 SLC4A9Q96Q91 983 aa37.83■■■■□ 3.65
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HOXB3-211ENST00000490677 AK7Q96M32 723 aa37.81■■■■□ 3.64
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HOXB3-211ENST00000490677 TJP1Q07157 1748 aa37.76■■■■□ 3.64
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HOXB3-211ENST00000490677 PHF14O94880 888 aa37.72■■■■□ 3.63
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HOXB3-211ENST00000490677 C4AP0C0L4 1744 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-211ENST00000490677 MRC1P22897 1456 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-211ENST00000490677 HMOX1P09601 288 aa37.71■■■■□ 3.63
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HOXB3-211ENST00000490677 CD2APQ9Y5K6 639 aa37.6■■■■□ 3.61
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HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa37.28■■■■□ 3.56
HOXB3-211ENST00000490677 DDR1Q08345 913 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-211ENST00000490677 NRXN2Q9P2S2 1712 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
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HOXB3-211ENST00000490677 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
HOXB3-211ENST00000490677 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP37.25■■■■□ 3.554e-6■■■■□ 20.8
HOXB3-211ENST00000490677 TEFQ10587 303 aa37.25■■■■□ 3.55
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF790Q6PG37 636 aa37.25■■■■□ 3.55
HOXB3-211ENST00000490677 COL15A1P39059 1388 aa37.25■■■■□ 3.55
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