RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM5Q71RC9 77 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 MORC1Q86VD1 984 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 DCAF5Q96JK2 942 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP4-210ENST00000489601 GNPATO15228 680 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 KDRP35968 1356 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 C1QTNF8P60827 252 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-210ENST00000489601 CABP4P57796 275 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 IL13P35225 146 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 MTHFSP49914 203 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 ADRA2BP18089 450 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS6KA4O75676 772 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 MMP10P09238 476 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-210ENST00000489601 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP10DQ9P241 1426 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 C4AP0C0L4 1744 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 GYS1P13807 737 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 RFC4P35249 363 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 ADCY9O60503 1353 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 TGFB2P61812 414 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 TJP1Q07157 1748 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-210ENST00000489601 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 HMOX1P09601 288 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 LGR6Q9HBX8 967 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 MRC1P22897 1456 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0G2JLW4 131 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-210ENST00000489601 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 DPEP1P16444 411 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 FKBP8Q14318 412 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 BCS1LQ9Y276 419 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC39A6Q13433 755 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNA3P22001 575 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP4-210ENST00000489601 FCHSD2O94868 740 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 TM4SF1P30408 202 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 DDR1Q08345 913 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 ZPR1O75312 459 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 PIM2Q9P1W9 311 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 CEP350Q5VT06 3117 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 NARFQ9UHQ1 456 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-210ENST00000489601 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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