RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.96■□□□□ 0.3
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NISCH-208ENST00000481211 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.95■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 NHSQ6T4R5 1651 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.94■□□□□ 0.3
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NISCH-208ENST00000481211 BTBD11A6QL63 1104 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-208ENST00000481211 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-208ENST00000481211 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
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NISCH-208ENST00000481211 KCNQ3O43525 872 aa16.79■□□□□ 0.28
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NISCH-208ENST00000481211 LY75O60449 1722 aa16.79■□□□□ 0.28
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NISCH-208ENST00000481211 SIK1P57059 783 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-208ENST00000481211 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.78■□□□□ 0.28
NISCH-208ENST00000481211 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
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NISCH-208ENST00000481211 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.77■□□□□ 0.28
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NISCH-208ENST00000481211 KRT24Q2M2I5 525 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-208ENST00000481211 STK31Q9BXU1 1019 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-208ENST00000481211 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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NISCH-208ENST00000481211 BAG6P46379 1132 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 KIF16BQ96L93 1317 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-208ENST00000481211 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.71■□□□□ 0.27
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