RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480476.1

NIN-211, Transcript of ninein, humanhuman

TSL 3

Gene NIN, Length 920 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIN-211ENST00000480476 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.26□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.26□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.26□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.26□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 GPC1P35052 558 aa7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 BANK1Q8NDB2 785 aa7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.25□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 RHOQP17081 205 aa7.24□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 CCDC125Q86Z20 511 aa7.24□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 SOCS7O14512 581 aa7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 LILRA1O75019 489 aa7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.23□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 FBXO45P0C2W1 286 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 AMPD1P23109 780 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 GATA4P43694 442 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 ZNF592Q92610 1267 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 KLRG1Q96E93 195 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 PHF24Q9UPV7 400 aa7.22□□□□□ -1.25
NIN-211ENST00000480476 APBB1O00213 710 aa7.21□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 NR1H3Q13133 447 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 WDR44Q5JSH3 913 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 LCE1DQ5T752 114 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 RNF20Q5VTR2 975 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 CYLDQ9NQC7 956 aa7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 ZMYND15Q9H091 742 aa7.19□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.18□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.18□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.18□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.17□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 DGKGP49619 791 aa7.17□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 FLIIQ13045 1269 aa7.17□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 F11P03951 625 aa7.16□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 LRP8Q14114 963 aa7.16□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.16□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 SNRKQ9NRH2 765 aa7.16□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 COBLO75128 1261 aa7.15□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 ERVK-9P63128 1117 aa7.15□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 BTBD6Q96KE9 485 aa7.15□□□□□ -1.26
NIN-211ENST00000480476 DYRK3O43781 588 aa7.14□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 NBPF15Q8N660 670 aa7.14□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.14□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 MEN1O00255 615 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 GPR37L1O60883 481 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 EPXP11678 715 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 POU4F2Q12837 409 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ARXQ96QS3 562 aa7.13□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 A0A1W2PRU2 124 aa7.12□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 NLRP3Q96P20 1036 aa7.12□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.12□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.12□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 BMP4P12644 408 aa7.11□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.11□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 GGA1Q9UJY5 639 aa7.11□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 TXKP42681 527 aa7.1□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 CLN3Q13286 438 aa7.1□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.1□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.1□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.1□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 TRAK2O60296 914 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ARAFP10398 606 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 SCTRP47872 440 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.09□□□□□ -1.27
NIN-211ENST00000480476 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 ABCC9O60706 1549 aa7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 MCM6Q14566 821 aa7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 MCTP1Q6DN14 999 aa7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 RNF135Q8IUD6 432 aa7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.08□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.07□□□□□ -1.28
NIN-211ENST00000480476 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms