RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	ITPK1	Q13572	414 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	AK7	Q96M32	723 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM5	Q71RC9	77 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.2	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	PHF14	O94880	888 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	SSFA2	P28290	1259 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	GNPAT	O15228	680 aa		28.16	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.16	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CTBP2-208	ENST00000476817	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	YY1	P25490	414 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.12	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.1	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		28.08	■■■□□ 2.09
CTBP2-208	ENST00000476817	UTRN	P46939	3433 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	RPS6KA4	O75676	772 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	MRC1	P22897	1456 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	GPR162	Q16538	588 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.04	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	ADRA2B	P18089	450 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.02	■■■□□ 2.08
CTBP2-208	ENST00000476817	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	RFC4	P35249	363 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.98	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	TJP1	Q07157	1748 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	MMP10	P09238	476 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
CTBP2-208	ENST00000476817	GYS1	P13807	737 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	FCHSD2	O94868	740 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	TEF	Q10587	303 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	GRIN3B	O60391	1043 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	C4A	P0C0L4	1744 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	CHD4	Q14839	1912 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	FKBP8	Q14318	412 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CTBP2-208	ENST00000476817	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	STARD3NL	O95772	234 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	MCM10	Q7L590	875 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNQ3	O43525	872 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	ZPR1	O75312	459 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CTBP2-208	ENST00000476817	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		27.81	■■■□□ 2.04

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