RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.09■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.09■□□□□ 0.49
TNS3-211ENST00000474346 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.08■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 MMP10P09238 476 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 ITPK1Q13572 414 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 ATG3Q9NT62 314 aa18.06■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 POLKQ9UBT6 870 aa18.06■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 KDRP35968 1356 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 KIF3CO14782 793 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 DCAF5Q96JK2 942 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 SMIM5Q71RC9 77 aa18.04■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.04■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 APLP1P51693 650 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 TOMM70O94826 608 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.02■□□□□ 0.48
TNS3-211ENST00000474346 C4AP0C0L4 1744 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 RPS6KA4O75676 772 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 RFC4P35249 363 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 BCS1LQ9Y276 419 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 GYS1P13807 737 aa17.99■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 A0A0G2JLW4 131 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 CABP4P57796 275 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 FCHSD2O94868 740 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TNS3-211ENST00000474346 DPEP1P16444 411 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 PIM2Q9P1W9 311 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 MTHFSP49914 203 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 CRKLP46109 303 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 KCNA3P22001 575 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 FSTL1Q12841 308 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 NMRK2Q9NPI5 230 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS3-211ENST00000474346 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 WDR90Q96KV7 1748 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 TJP1Q07157 1748 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 ZPR1O75312 459 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 MORC1Q86VD1 984 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 PANK3Q9H999 370 aa17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 FKBP8Q14318 412 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 RNF181Q9P0P0 153 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 TM4SF1P30408 202 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 DDR1Q08345 913 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 SULT6B1Q6IMI4 303 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.83■□□□□ 0.45
TNS3-211ENST00000474346 JMYQ8N9B5 988 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 KLRG1Q96E93 195 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 SBF1O95248 1867 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 IL13P35225 146 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS3-211ENST00000474346 NARFQ9UHQ1 456 aa17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms