RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, human

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20B-209	ENST00000470356	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		42.61	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	ATP6V1A	P38606	617 aa		42.6	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	ITPK1	Q13572	414 aa		42.59	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	MTHFS	P49914	203 aa		42.58	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	GPR162	Q16538	588 aa		42.57	■■■■■ 4.41
HMG20B-209	ENST00000470356	SSFA2	P28290	1259 aa		42.56	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		42.55	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		42.55	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	PHF14	O94880	888 aa		42.54	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	CABP4	P57796	275 aa		42.52	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	SMIM5	Q71RC9	77 aa		42.52	■■■■■ 4.4
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		42.51	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	GNPAT	O15228	680 aa		42.49	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		42.48	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		42.48	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		42.46	■■■■■ 4.39
HMG20B-209	ENST00000470356	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		42.43	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		42.42	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		42.4	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	HMOX1	P09601	288 aa		42.39	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
HMG20B-209	ENST00000470356	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		42.36	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		42.36	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	42.34	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	GRIN3B	O60391	1043 aa		42.33	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	ADRA2B	P18089	450 aa		42.32	■■■■■ 4.37
HMG20B-209	ENST00000470356	RPS6KA4	O75676	772 aa		42.3	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	LGR6	Q9HBX8	967 aa		42.3	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		42.29	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		42.26	■■■■■ 4.36
HMG20B-209	ENST00000470356	MMP10	P09238	476 aa		42.24	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	MRC1	P22897	1456 aa		42.23	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	RFC4	P35249	363 aa		42.22	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	TJP1	Q07157	1748 aa		42.21	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		42.2	■■■■■ 4.35
HMG20B-209	ENST00000470356	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
HMG20B-209	ENST00000470356	GYS1	P13807	737 aa		42.18	■■■■■ 4.34
HMG20B-209	ENST00000470356	C4A	P0C0L4	1744 aa		42.16	■■■■■ 4.34
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC39A6	Q13433	755 aa		42.13	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		42.13	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		42.12	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	CFAP53	Q96M91	514 aa		42.11	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		42.09	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		42.08	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		42.07	■■■■■ 4.33
HMG20B-209	ENST00000470356	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		42.06	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		42.05	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	TGFB2	P61812	414 aa		42.05	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	PPP2R1A	P30153	589 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		42.03	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		42.01	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		42.01	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.01	■■■■■ 4.32
HMG20B-209	ENST00000470356	FKBP8	Q14318	412 aa		42	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	TEF	Q10587	303 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		41.99	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	PRKAR2B	P31323	418 aa		41.98	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		41.98	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		41.97	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356		A0A0G2JLW4	131 aa		41.96	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	ZPR1	O75312	459 aa		41.95	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
HMG20B-209	ENST00000470356	DDR1	Q08345	913 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	C1QTNF8	P60827	252 aa		41.92	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		41.91	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	41.91	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	DPEP1	P16444	411 aa		41.91	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	TM4SF1	P30408	202 aa		41.91	■■■■■ 4.3
HMG20B-209	ENST00000470356	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	41.91	■■■■■ 4.3

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