RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-208ENST00000469534 PTGDRQ13258 359 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 LAPTM4AQ15012 233 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 ORAI2Q96SN7 254 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 SLC24A1O60721 1099 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 ATF3P18847 181 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 FBLN1P23142 703 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 NME9Q86XW9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 MSH6P52701 1360 aa7.1□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 PLCB2Q00722 1185 aa7.1□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.1□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 MORC1Q86VD1 984 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 MRS2Q9HD23 443 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGA6-208ENST00000469534 MST1RQ04912 1400 aa7.09□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.09□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.09□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 SEMA3EO15041 775 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 FOXO3O43524 673 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 APLP1P51693 650 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PIK3C2AO00443 1686 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 USP6P35125 1406 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 KIF1AQ12756 1690 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 FYB1O15117 783 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PPP2R1AP30153 589 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PSME1Q06323 249 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 MTRQ99707 1265 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 GFRA3O60609 400 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PIP4K2BP78356 416 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 RALBP1Q15311 655 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 SLF2Q8IX21 1173 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 IL21Q9HBE4 155 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ZNF516Q92618 1163 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 NECTIN2Q92692 538 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 CCER2I3L3R5 266 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 RNF40O75150 1001 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 BRINP3Q76B58 766 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ABTB2Q8N961 1025 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 COG3Q96JB2 828 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 SLAIN2Q9P270 581 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 LTN1O94822 1766 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 DCCP43146 1447 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 SSH2Q76I76 1423 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 RGPD5Q99666 1765 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 LCE2BO14633 110 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 DNAJB2P25686 324 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 MTHFSP49914 203 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 NLRP13Q86W25 1043 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 PEAK1Q9H792 1746 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 SHPRHQ149N8 1683 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 ALS2Q96Q42 1657 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGA6-208ENST00000469534 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 PHLPP1O60346 1717 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 FCHSD2O94868 740 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 NSD2O96028 1365 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA6-208ENST00000469534 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms