RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.64■□□□□ 0.89
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SYP-204ENST00000469389 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.62■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.62■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 MRC1P22897 1456 aa20.62■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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SYP-204ENST00000469389 IFT57Q9NWB7 429 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-204ENST00000469389 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.56■□□□□ 0.88
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SYP-204ENST00000469389 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.51■□□□□ 0.87
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SYP-204ENST00000469389 AK7Q96M32 723 aa20.42■□□□□ 0.86
SYP-204ENST00000469389 STK32BQ9NY57 414 aa20.42■□□□□ 0.86
SYP-204ENST00000469389 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.42■□□□□ 0.86
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SYP-204ENST00000469389 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.4■□□□□ 0.86
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SYP-204ENST00000469389 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.37■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYP-204ENST00000469389 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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