RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-203ENST00000468641 DKK1O94907 266 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRZ1-203ENST00000468641 TLR1Q15399 786 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRZ1-203ENST00000468641 VSIG8P0DPA2 414 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 OGFOD1Q8N543 542 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF358Q9NW07 568 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP3Q9Y6I4 520 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARID3CA6NKF2 412 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 PSME1Q06323 249 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 C14orf37Q86TY3 774 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRIM50Q86XT4 487 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ITGA6P23229 1130 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 SMTNP53814 917 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 MTFR1Q15390 333 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 C4orf17Q53FE4 359 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 PHKA2P46019 1235 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 EPHA4P54764 986 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCDC102BQ68D86 513 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 TAS1R3Q7RTX0 852 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 GMPRP36959 345 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 ATP1A2P50993 1020 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 WDR44Q5JSH3 913 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 SIX5Q8N196 739 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 IRF7Q92985 503 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRZ1-203ENST00000468641 A6NJY4 79 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 DYRK1BQ9Y463 629 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 RASA1P20936 1047 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 FOXK2Q01167 660 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 PTK7Q13308 1070 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 GNASQ5JWF2 1037 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 TNS4Q8IZW8 715 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 SFI1A8K8P3 1242 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CDK2AP1O14519 115 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 THBS1P07996 1170 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 VWA5B2Q8N398 1253 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 WIPF1O43516 503 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 VRTNQ9H8Y1 702 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L15C9J2P7 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L10C9JJH3 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L12C9JPN9 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L11C9JVI0 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L21D6R901 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L18D6R9N7 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L22D6RA61 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L19D6RCP7 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L20D6RJB6 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 BACH1O14867 736 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 RFX1P22670 979 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRT76Q01546 638 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP17L24Q0WX57 530 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 DBN1Q16643 649 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 CDCA8Q53HL2 280 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRZ1-203ENST00000468641 PLA2G4AP47712 749 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARXQ96QS3 562 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 CDC14CA4D256 554 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 FAM196BA6NMK8 535 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TBCELQ5QJ74 424 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 M0R2N6 131 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 F11P03951 625 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 MSX1P28360 303 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 GPAMQ9HCL2 828 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 A0A1B0GTH6 734 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 ATP4AP20648 1035 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 DPYDQ12882 1025 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 SV2AQ7L0J3 742 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRZ1-203ENST00000468641 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms