RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa41.72■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 SGIP1Q9BQI5 828 aa41.72■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 AK7Q96M32 723 aa41.71■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 MSH5O43196 834 aa41.7■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 ITPK1Q13572 414 aa41.7■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 LINC00116Q8NCU8 138 aa41.7■■■■■ 4.27
CHKB-205ENST00000468532 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 LGR6Q9HBX8 967 aa41.69■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 UBR3Q6ZT12 1888 aa41.67■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 RNMTO43148 476 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 ZNF831Q5JPB2 1677 aa41.66■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 PRKAR2BP31323 418 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 COL24A1Q17RW2 1714 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 RSPH6AQ9H0K4 717 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 SLC52A2Q9HAB3 445 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 MRC1P22897 1456 aa41.65■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 FLAD1Q8NFF5 587 aa41.64■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 GAS2L2Q8NHY3 880 aa41.64■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 SLC4A9Q96Q91 983 aa41.64■■■■■ 4.26
CHKB-205ENST00000468532 ARXQ96QS3 562 aa41.61■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 AMIGO3Q86WK7 504 aa41.6■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 MAP3K5Q99683 1374 aa41.6■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 PHF14O94880 888 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 POLD1P28340 1107 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 PHACTR3Q96KR7 559 aa41.58■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 GNPATO15228 680 aa41.57■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 SMIM5Q71RC9 77 aa41.57■■■■■ 4.25
CHKB-205ENST00000468532 GNAT3A8MTJ3 354 aa41.56■■■■■ 4.24
CHKB-205ENST00000468532 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
CHKB-205ENST00000468532 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
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CHKB-205ENST00000468532 SSFA2P28290 1259 aa41.54■■■■■ 4.24
CHKB-205ENST00000468532 RALBP1Q15311 655 aa41.54■■■■■ 4.24
CHKB-205ENST00000468532 MSL1Q68DK7 614 aa41.54■■■■■ 4.24
CHKB-205ENST00000468532 TJP1Q07157 1748 aa41.5■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 SYT17Q9BSW7 474 aa41.5■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 SLC39A6Q13433 755 aa41.49■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa41.48■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 IL17REQ8NFR9 667 aa41.48■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 TEFQ10587 303 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 KLHL34Q8N239 644 aa41.45■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 KCPQ6ZWJ8 1503 aa41.44■■■■■ 4.23
CHKB-205ENST00000468532 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CHKB-205ENST00000468532 UBR2Q8IWV8 1755 aa41.41■■■■■ 4.22
CHKB-205ENST00000468532 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa41.4■■■■■ 4.22
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CHKB-205ENST00000468532 TRAPPC3LQ5T215 181 aa41.39■■■■■ 4.22
CHKB-205ENST00000468532 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
CHKB-205ENST00000468532 RPS6KA4O75676 772 aa41.38■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 DNAJC10Q8IXB1 793 aa41.38■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 TTC5Q8N0Z6 440 aa41.38■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 NEFMP07197 916 aa41.36■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 ADRA2BP18089 450 aa41.35■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 C4AP0C0L4 1744 aa41.32■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 MCM10Q7L590 875 aa41.32■■■■■ 4.21
CHKB-205ENST00000468532 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 ZNF790Q6PG37 636 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 VSIG10Q8N0Z9 540 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHF1Q96S99 279 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 DLG5Q8TDM6 1919 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 CCDC87Q9NVE4 849 aa41.29■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 RFC4P35249 363 aa41.28■■■■■ 4.2
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CHKB-205ENST00000468532 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
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CHKB-205ENST00000468532 BTBD11A6QL63 1104 aa41.26■■■■■ 4.2
CHKB-205ENST00000468532 NLGN2Q8NFZ4 835 aa41.25■■■■■ 4.19
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CHKB-205ENST00000468532 GYS1P13807 737 aa41.21■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 NFE2L2Q16236 605 aa41.21■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 NLGN1Q8N2Q7 840 aa41.21■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 FMNL2Q96PY5 1086 aa41.21■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 KCNQ3O43525 872 aa41.2■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 MMP10P09238 476 aa41.2■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.19
CHKB-205ENST00000468532 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa41.19■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 CD2APQ9Y5K6 639 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 STARD3NLO95772 234 aa41.17■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CHKB-205ENST00000468532 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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