RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 G2E3Q7L622 706 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 SLC4A2P04920 1241 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 21.8
PREB-208ENST00000468045 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.56■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 ZFYVE9O95405 1425 aa21.55■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.55■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 FIBPO43427 364 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 CHMLP26374 656 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.54■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 MCM2P49736 904 aa21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 PTPRMP28827 1452 aa21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 KDM4AO75164 1064 aa21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 MCCP23508 829 aa21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 UVSSAQ2YD98 709 aa21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.52■■□□□ 1.04
PREB-208ENST00000468045 MX1P20591 662 aa21.52■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.52■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.51■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.51■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.51■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.51■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 HMMRO75330 724 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 CPA1P15085 419 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.49■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.48■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.47■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 NECTIN2Q92692 538 aa21.47■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.46■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.46■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.46■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 SYT1P21579 422 aa21.46■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PREB-208ENST00000468045 CHL1O00533 1208 aa21.45■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.45■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 ANAPC15P60006 121 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 UBE2HP62256 183 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 PTGS1P23219 599 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.44■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 STX6O43752 255 aa21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 LARGE1O95461 756 aa21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 RASEFQ8IZ41 740 aa21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 PTPRCP08575 1304 aa21.43■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 AK2P54819 239 aa21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 GNAI2P04899 355 aa21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 LRMPQ12912 555 aa21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 FOXO3O43524 673 aa21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 SOX12O15370 315 aa21.41■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 RAPGEF3O95398 923 aa21.41■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 CAMK4Q16566 473 aa21.41■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 RUFY3Q7L099 469 aa21.41■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 ANKRD7Q92527 254 aa21.41■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 KIAA0232Q92628 1395 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 F13A1P00488 732 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 HSPA4P34932 840 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 COG3Q96JB2 828 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.4■■□□□ 1.02
PREB-208ENST00000468045 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.39■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.39■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 LUZP1Q86V48 1076 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 PIK3C2BO00750 1634 aa21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PREB-208ENST00000468045 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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