RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 PHF14O94880 888 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 MMP10P09238 476 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 AMPHP49418 695 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 SIK1P57059 783 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 ITPK1Q13572 414 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 TMC1Q8TDI8 760 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 COG3Q96JB2 828 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.68□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.67□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 A0A0G2JLW4 131 aa14.66□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 BCS1LQ9Y276 419 aa14.66□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 CAPN15O75808 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 SLC34A2O95436 690 aa14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 DPEP1P16444 411 aa14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 TESK2Q96S53 571 aa14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LAMC1-202ENST00000466964 DCAF5Q96JK2 942 aa14.64□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 FLT4P35916 1363 aa14.63□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 FYB1O15117 783 aa14.63□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 GNPATO15228 680 aa14.63□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.63□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.63□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 TONSLQ96HA7 1378 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.62□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 GYS1P13807 737 aa14.61□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.61□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.61□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 FCHSD2O94868 740 aa14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 ATG3Q9NT62 314 aa14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.076e-9■□□□□ 11.1
LAMC1-202ENST00000466964 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 TMF1P82094 1093 aa14.59□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.59□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.59□□□□□ -0.07
LAMC1-202ENST00000466964 ATP6V1AP38606 617 aa14.58□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 RRAGCQ9HB90 399 aa14.58□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.58□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.57□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.57□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.57□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.56□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.56□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 PIM2Q9P1W9 311 aa14.56□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 RPS6KA4O75676 772 aa14.55□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 PHKG2P15735 406 aa14.55□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 RNF181Q9P0P0 153 aa14.55□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.55□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 DDR1Q08345 913 aa14.54□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 SPG7Q9UQ90 795 aa14.54□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 TJP1Q07157 1748 aa14.53□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 POTECB2RU33 542 aa14.53□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.52□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LAMC1-202ENST00000466964 GLTPD2A6NH11 291 aa14.52□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.52□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.52□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.51□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.51□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 EYA1Q99502 592 aa14.51□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.5□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.49□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 TM4SF1P30408 202 aa14.49□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 CHRNA5P30532 468 aa14.49□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 FKBP8Q14318 412 aa14.49□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 SLC24A1O60721 1099 aa14.48□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 RFC4P35249 363 aa14.48□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 RASSF7Q02833 373 aa14.48□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 NEUROD1Q13562 356 aa14.48□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.47□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.46□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 LMNB1P20700 586 aa14.46□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.46□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 CREBZFQ9NS37 354 aa14.46□□□□□ -0.09
LAMC1-202ENST00000466964 NFKBIEO00221 500 aa14.45□□□□□ -0.1
LAMC1-202ENST00000466964 FOXN1O15353 648 aa14.45□□□□□ -0.1
LAMC1-202ENST00000466964 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms