RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRN-211ENST00000462351 CEP63Q96MT8 703 aa16.89■□□□□ 0.29
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PTPRN-211ENST00000462351 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.8■□□□□ 0.28
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PTPRN-211ENST00000462351 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 CTAGE5O15320 804 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRN-211ENST00000462351 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
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