RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462272.5

RARB-205, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene RARB, Length 1,258 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-205ENST00000462272 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 NFAT5O94916 1531 aa7.37□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 A0A1W2PP64 1363 aa7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 AKAP12Q02952 1782 aa7.36□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 LRRC37A3O60309 1634 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 DDB1Q16531 1140 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 TMC2Q8TDI7 906 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 TESK2Q96S53 571 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.35□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 USP47Q96K76 1375 aa7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 G3V3G9 751 aa7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 PLPP6Q8IY26 295 aa7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RARB-205ENST00000462272 USP31Q70CQ4 1352 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 COL18A1P39060 1754 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.33□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ABCC6O95255 1503 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ERBB3P21860 1342 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 TNS2Q63HR2 1409 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 CCDC7Q96M83 1385 aa7.32□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 LRP5O75197 1615 aa7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 TMF1P82094 1093 aa7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 COG3Q96JB2 828 aa7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.31□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PEAK1Q9H792 1746 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 EXOC5O00471 708 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 DPYSL4O14531 572 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 FBLN1P23142 703 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 NBPF14Q5TI25 921 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 USP54Q70EL1 1684 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 RREB1Q92766 1687 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.3□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 IL2RBP14784 551 aa7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 AMPHP49418 695 aa7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 PDIA6Q15084 440 aa7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 RGPD5Q99666 1765 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 KCNQ2O43526 872 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 HOXC9P31274 260 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 IP6K1Q92551 441 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 LTN1O94822 1766 aa7.28□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 BCL9O00512 1426 aa7.27□□□□□ -1.24
RARB-205ENST00000462272 ZMYND10O75800 440 aa7.27□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 CDCA8Q53HL2 280 aa7.27□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.27□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.27□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 RTL1A6NKG5 1358 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 FYB1O15117 783 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 PLSCR1O15162 318 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 TXNRD1Q16881 649 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 MEGF6O75095 1541 aa7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 OXER1Q8TDS5 423 aa7.25□□□□□ -1.25
RARB-205ENST00000462272 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms