RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.07■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 ITPK1Q13572 414 aa28.06■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.05■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 C5P01031 1676 aa28.04■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 NUDCQ9Y266 331 aa28.03■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.02■■■□□ 2.08
SIKE1-204ENST00000462123 C4BP0C0L5 1744 aa28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 PPP2R1AP30153 589 aa28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.99■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 GNPATO15228 680 aa27.99■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 ADRA2BP18089 450 aa27.99■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.99■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.98■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.97■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 LGR6Q9HBX8 967 aa27.97■■■□□ 2.07
SIKE1-204ENST00000462123 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
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SIKE1-204ENST00000462123 PHF14O94880 888 aa27.95■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.95■■■□□ 2.06
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SIKE1-204ENST00000462123 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.94■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.94■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 MRC1P22897 1456 aa27.94■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.92■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 FCHSD2O94868 740 aa27.92■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 MSL1Q68DK7 614 aa27.92■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.92■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.9■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 YY1P25490 414 aa27.89■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.89■■■□□ 2.06
SIKE1-204ENST00000462123 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SIKE1-204ENST00000462123 PRKAR2BP31323 418 aa27.88■■■□□ 2.05
SIKE1-204ENST00000462123 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
SIKE1-204ENST00000462123 KLHL34Q8N239 644 aa27.87■■■□□ 2.05
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SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.87■■■□□ 2.05
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SIKE1-204ENST00000462123 IL17REQ8NFR9 667 aa27.86■■■□□ 2.05
SIKE1-204ENST00000462123 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.86■■■□□ 2.05
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SIKE1-204ENST00000462123 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.85■■■□□ 2.05
SIKE1-204ENST00000462123 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.84■■■□□ 2.05
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SIKE1-204ENST00000462123 GPR162Q16538 588 aa27.84■■■□□ 2.05
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SIKE1-204ENST00000462123 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.82■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.81■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.81■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 GRIN3BO60391 1043 aa27.8■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 GYS1P13807 737 aa27.8■■■□□ 2.04
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SIKE1-204ENST00000462123 ZNF790Q6PG37 636 aa27.79■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 MMP10P09238 476 aa27.78■■■□□ 2.04
SIKE1-204ENST00000462123 STARD3NLO95772 234 aa27.77■■■□□ 2.04
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SIKE1-204ENST00000462123 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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SIKE1-204ENST00000462123 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.73■■■□□ 2.03
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SIKE1-204ENST00000462123 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.72■■■□□ 2.03
SIKE1-204ENST00000462123 BTBD11A6QL63 1104 aa27.71■■■□□ 2.03
SIKE1-204ENST00000462123 TJP1Q07157 1748 aa27.7■■■□□ 2.03
SIKE1-204ENST00000462123 ZPR1O75312 459 aa27.7■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.69■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 NARFQ9UHQ1 456 aa27.68■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.68■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 A0A087WZG4 1122 aa27.67■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 UTRNP46939 3433 aa27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 TM4SF1P30408 202 aa27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-204ENST00000462123 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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