RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 HPS1Q92902 700 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CNKSR1Q969H4 720 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PRU2 124 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NJY4 79 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 PRMT3O60678 531 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 IGFBP4P22692 258 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 WEE1P30291 646 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 SMTNP53814 917 aa10□□□□□ -0.81
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RABGGTB-205ENST00000462042 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 UPP2O95045 317 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 IL2RAP01589 272 aa9.99□□□□□ -0.81
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RABGGTB-205ENST00000462042 OCLNQ16625 522 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF15Q8N660 670 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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RABGGTB-205ENST00000462042 FOXO3O43524 673 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHA4P54764 986 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 TNS4Q8IZW8 715 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK2AP1O14519 115 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 AVPP01185 164 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 GPC1P35052 558 aa9.97□□□□□ -0.81
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RABGGTB-205ENST00000462042 TLR1Q15399 786 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM187AA6NFU0 413 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 MEN1O00255 615 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 COL26A1Q96A83 441 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 DGAT1O75907 488 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXK2Q01167 660 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 CENPCQ03188 943 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 LAPTM4AQ15012 233 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINT1O43278 529 aa9.93□□□□□ -0.82
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RABGGTB-205ENST00000462042 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 PKDCCQ504Y2 493 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 GFRA3O60609 400 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 SCARF1Q14162 830 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 C21orf2O43822 256 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 LGR5O75473 907 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 BMP2P12643 396 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 TEAD4Q15561 434 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 GNASQ5JWF2 1037 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 SERTM1A2A2V5 107 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEAQ6S8J7 498 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 AXIN1O15169 862 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-205ENST00000462042 CABP1Q9NZU7 370 aa9.87□□□□□ -0.83
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