RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 SLURP2P0DP57 97 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SKIP12755 728 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GDF10P55107 478 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 C4orf17Q53FE4 359 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 INHAP05111 366 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SVOPQ8N4V2 548 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 GPAMQ9HCL2 828 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GTH6 734 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 POM121CA8CG34 1229 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS2O95450 1211 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 EML3Q32P44 896 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 WHAMMQ8TF30 809 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-204ENST00000461653 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MBIPQ9NS73 344 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NCOA4Q13772 614 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NOD1Q9Y239 953 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 THBS1P07996 1170 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SMTNP53814 917 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L5A8MUK1 530 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 MSX1P28360 303 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PLA2G4AP47712 749 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2IP78347 998 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PGBD3Q8N328 593 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 RUBCNLQ9H714 662 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 IGF1RP08069 1367 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF15O94989 841 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 PSME1Q06323 249 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-204ENST00000461653 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 MX2P20592 715 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP3K10Q02779 954 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 UCN2Q96RP3 112 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 A6NJY4 79 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 MTFR1Q15390 333 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 EFHC2Q5JST6 749 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK2AP1O14519 115 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 BACH1O14867 736 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF24Q9UPV7 400 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 USP3Q9Y6I4 520 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L3A6NCW0 530 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L4A6NCW7 530 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNMA1Q12791 1236 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 AIDAQ96BJ3 306 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF358Q9NW07 568 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP9BO43861 1147 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP4AP20648 1035 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM50Q86XT4 487 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 ACDQ96AP0 544 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 CABP1Q9NZU7 370 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP2K3P46734 347 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 GLMNQ92990 594 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-204ENST00000461653 BCRP11274 1271 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP1A2P50993 1020 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 GSK3AP49840 483 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-204ENST00000461653 BNIP3LO60238 219 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.6 ms