RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRA-208	ENST00000455631	TOMM70	O94826	608 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	EYA1	Q99502	592 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76	1e-7	■■■□□ 14.6
PTPRA-208	ENST00000455631	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	PHKG2	P15735	406 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	TGFB2	P61812	414 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631		A0A0G2JLW4	131 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	KDR	P35968	1356 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRA-208	ENST00000455631	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	DPEP1	P16444	411 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	FCHSD2	O94868	740 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	ADRA2B	P18089	450 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRA-208	ENST00000455631	GYS1	P13807	737 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	RFC4	P35249	363 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRA-208	ENST00000455631	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	KCNA3	P22001	575 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	HTRA3	P83110	453 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	CABP4	P57796	275 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTPRA-208	ENST00000455631	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	FSTL1	Q12841	308 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	DDR1	Q08345	913 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	FKBP8	Q14318	412 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	TJP1	Q07157	1748 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRA-208	ENST00000455631	SBF1	O95248	1867 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	CHRNA5	P30532	468 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	JMY	Q8N9B5	988 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	MTHFS	P49914	203 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PTPRA-208	ENST00000455631	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	CAPN15	O75808	1086 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	RASSF7	Q02833	373 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	ZPR1	O75312	459 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PTPRA-208	ENST00000455631	TM4SF1	P30408	202 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PTPRA-208	ENST00000455631	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.82	■■■□□ 2.68

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