RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 HOOK3Q86VS8 718 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ATP2B3Q16720 1220 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA24Q86W54 205 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM24O75264 130 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 VCAM1P19320 739 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MLECQ14165 292 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC38Q502W7 563 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD62A6NC57 917 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 KINO60870 393 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 XBP1P17861 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PSMC4P43686 418 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PNMA2Q9UL42 364 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SMAPO00193 183 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FYB1O15117 783 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CRBNQ96SW2 442 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 BICD1Q96G01 975 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 VPS18Q9P253 973 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SYCE3A1L190 88 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIA3O75145 1194 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIA2O75334 1257 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PRPHP41219 470 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IQCA1Q86XH1 822 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 USP33Q8TEY7 942 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PANK3Q9H999 370 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MARCH6O60337 910 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IRF6O14896 467 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MTA1Q13330 715 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 WDR70Q9NW82 654 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ELF1P32519 619 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 MSL1Q68DK7 614 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM74Q86UV6 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM73Q86UV7 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CABS1Q96KC9 395 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SLC8A1P32418 973 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SASH1O94885 1247 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TSC22D3Q99576 134 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 RNF8O76064 485 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 GJA8P48165 433 aa6.48□□□□□ -1.37
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