RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 ITPK1Q13572 414 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 GPR162Q16538 588 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 KLHL34Q8N239 644 aa19.61■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 CABP4P57796 275 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 MSL1Q68DK7 614 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.6■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.59■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
TNS1-208ENST00000439083 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.58■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 GNPATO15228 680 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 PHF14O94880 888 aa19.57■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.56■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 UTRNP46939 3433 aa19.56■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 GRIN3BO60391 1043 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 ADRA2BP18089 450 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.54■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.53■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.53■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 SMIM5Q71RC9 77 aa19.53■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TNS1-208ENST00000439083 RPS6KA4O75676 772 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.51■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 HMOX1P09601 288 aa19.5■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.49■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 CHD4Q14839 1912 aa19.49■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 LGR6Q9HBX8 967 aa19.47■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 MMP10P09238 476 aa19.46■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 RFC4P35249 363 aa19.46■□□□□ 0.71
TNS1-208ENST00000439083 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 GYS1P13807 737 aa19.44■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 MRC1P22897 1456 aa19.43■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.43■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 TGFB2P61812 414 aa19.42■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 CFAP53Q96M91 514 aa19.42■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.41■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.41■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
TNS1-208ENST00000439083 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 NUDCQ9Y266 331 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.39■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 SLC39A6Q13433 755 aa19.38■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.36■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 TEFQ10587 303 aa19.36■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 IL17REQ8NFR9 667 aa19.36■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 TJP1Q07157 1748 aa19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 PPP2R1AP30153 589 aa19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.35■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 ZPR1O75312 459 aa19.34■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 C1QTNF8P60827 252 aa19.34■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 FKBP8Q14318 412 aa19.34■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.34■□□□□ 0.69
TNS1-208ENST00000439083 FCHSD2O94868 740 aa19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 STARD3NLO95772 234 aa19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 TM4SF1P30408 202 aa19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 PRKAR2BP31323 418 aa19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 ZNF790Q6PG37 636 aa19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 C4AP0C0L4 1744 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 A0A0G2JLW4 131 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 NARFQ9UHQ1 456 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.32■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.31■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 ADCY9O60503 1353 aa19.31■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 DPEP1P16444 411 aa19.3■□□□□ 0.68
TNS1-208ENST00000439083 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms