RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438436.2

RNASEH1-AS1-202, RNASEH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNASEH1-AS1, Length 1,218 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 GNPATO15228 680 aa22.57■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FCHSD2O94868 740 aa22.57■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KCNA3P22001 575 aa22.57■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PIGBQ92521 554 aa22.57■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.56■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.55■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.55■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SIK1P57059 783 aa22.55■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.53■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.52■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RNF181Q9P0P0 153 aa22.52■■□□□ 1.2
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.51■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 COG3Q96JB2 828 aa22.51■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DCAF5Q96JK2 942 aa22.51■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KDRP35968 1356 aa22.5■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NCAPD2Q15021 1401 aa22.49■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.49■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.49■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 GYS1P13807 737 aa22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ATP6V1AP38606 617 aa22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TMF1P82094 1093 aa22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 INSRP06213 1382 aa22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RASSF7Q02833 373 aa22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PIM2Q9P1W9 311 aa22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TJP1Q07157 1748 aa22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ATG3Q9NT62 314 aa22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FLT4P35916 1363 aa22.4■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.4■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.4■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.4■■□□□ 1.18
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FOXN1O15353 648 aa22.39■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CHRNA5P30532 468 aa22.39■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.39■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 DDR1Q08345 913 aa22.38■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.37■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 POTECB2RU33 542 aa22.36■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.35■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 GLTPD2A6NH11 291 aa22.35■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FYB1O15117 783 aa22.35■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ADRA2BP18089 450 aa22.35■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.34■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.34■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.33■■□□□ 1.17
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RPS6KA4O75676 772 aa22.32■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RFC4P35249 363 aa22.32■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FAM161AQ3B820 660 aa22.32■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TONSLQ96HA7 1378 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PHKG2P15735 406 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 FKBP8Q14318 412 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TESK2Q96S53 571 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 SPG7Q9UQ90 795 aa22.31■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.3■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CREBZFQ9NS37 354 aa22.29■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.29■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CACNA1SQ13698 1873 aa22.28■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 LMNB1P20700 586 aa22.28■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CNTNAP1P78357 1384 aa22.27■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.27■■□□□ 1.16
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NEUROD1Q13562 356 aa22.26■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 POTEIP0CG38 1075 aa22.25■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 POTEJP0CG39 1038 aa22.25■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.25■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 NFKBIEO00221 500 aa22.24■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 ABHD8Q96I13 439 aa22.22■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 EYA1Q99502 592 aa22.22■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 TM4SF1P30408 202 aa22.21■■□□□ 1.15
RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms