RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT24Q2M2I5 525 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 IL17REQ8NFR9 667 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 NUCB1Q02818 461 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 USP21Q9UK80 565 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 STK31Q9BXU1 1019 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC4A2P04920 1241 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 COL18A1P39060 1754 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXB7P09629 217 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 RGPD5Q99666 1765 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA3Q99758 1704 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP10DQ9P241 1426 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CHRNA2Q15822 529 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 ERBB3P21860 1342 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SLIT2O94813 1529 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 RXRBP28702 533 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 BTG4Q9NY30 223 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CPDO75976 1380 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 DCTPP1Q9H773 170 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 FLIIQ13045 1269 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 TEFQ10587 303 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 G2E3Q7L622 706 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP85Q6P2H3 762 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 LNPKQ9C0E8 428 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 LGR6Q9HBX8 967 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 ATRNO75882 1429 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 HMMRO75330 724 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 MEIS3Q99687 375 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC24BO95487 1268 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 BTBD11A6QL63 1104 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 GNAI3P08754 354 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 STRN4Q9NRL3 753 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS72Q15906 364 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 F6X3S4 739 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 GNAI2P04899 355 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 SPG7Q9UQ90 795 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 MRC1P22897 1456 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 SOCS7O14512 581 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 MEGF6O75095 1541 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 EVA1CP58658 441 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-202ENST00000435136 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms