RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MTHFSP49914 203 aa21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CABP4P57796 275 aa21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ITPK1Q13572 414 aa21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C1orf141Q5JVX7 400 aa21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADRA2BP18089 450 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MSL1Q68DK7 614 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GNPATO15228 680 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHF14O94880 888 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RPS6KA4O75676 772 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TGFB2P61812 414 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RFC4P35249 363 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MMP10P09238 476 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SMIM5Q71RC9 77 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C1QTNF8P60827 252 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GYS1P13807 737 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 UTRNP46939 3433 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HMOX1P09601 288 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LGR6Q9HBX8 967 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MRC1P22897 1456 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CFAP53Q96M91 514 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.77■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADCY9O60503 1353 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZPR1O75312 459 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 C4AP0C0L4 1744 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TM4SF1P30408 202 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATP10DQ9P241 1426 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NUDCQ9Y266 331 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A0G2JLW4 131 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 STARD3NLO95772 234 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NARFQ9UHQ1 456 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TEFQ10587 303 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC39A6Q13433 755 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FKBP8Q14318 412 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TJP1Q07157 1748 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DPEP1P16444 411 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 IL17REQ8NFR9 667 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PIM2Q9P1W9 311 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCS1LQ9Y276 419 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A087WZG4 1122 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KCNA3P22001 575 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF790Q6PG37 636 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FCHSD2O94868 740 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDR1Q08345 913 aa20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms