RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADCY9O60503 1353 aa14.91□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPA6P17066 643 aa14.91□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPG7Q9UQ90 795 aa14.9□□□□□ -0.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP27B1O15528 508 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSFA2P28290 1259 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 PANK3Q9H999 370 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEP350Q5VT06 3117 aa14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNPATO15228 680 aa14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V1AP38606 617 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIK1P57059 783 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIGBQ92521 554 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM5Q71RC9 77 aa14.85□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.84□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.84□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.83□□□□□ -0.03
APOBEC3C-202ENST00000428892 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.83□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP10P09238 476 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCS1LQ9Y276 419 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 C4AP0C0L4 1744 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCAPD2Q15021 1401 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR90Q96KV7 1748 aa14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHKG2P15735 406 aa14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 APLP1P51693 650 aa14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITPK1Q13572 414 aa14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF3CO14782 793 aa14.79□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.79□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 TGFB2P61812 414 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 EYA1Q99502 592 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.77□□□□□ -0.04
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOMM70O94826 608 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 FCHSD2O94868 740 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 RFC4P35249 363 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATG3Q9NT62 314 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLKQ9UBT6 870 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0G2JLW4 131 aa14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 KDRP35968 1356 aa14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPEP1P16444 411 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 SBF1O95248 1867 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 CABP4P57796 275 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 MORC1Q86VD1 984 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF5Q96JK2 942 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 TJP1Q07157 1748 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 GYS1P13807 737 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIM2Q9P1W9 311 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPS6KA4O75676 772 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO3Q9UK99 471 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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