RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 MEIS3Q99687 375 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 SEC24BO95487 1268 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-209ENST00000428120 GCC1Q96CN9 775 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 MEGF6O75095 1541 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 ATP10DQ9P241 1426 aa29.11■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 CPDO75976 1380 aa29.1■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 CEP85Q6P2H3 762 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 BCL11AQ9H165 835 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.08■■■□□ 2.25
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA1FO60840 1977 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.07■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA1P04083 346 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 SPG7Q9UQ90 795 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 PHKG2P15735 406 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 HOXB7P09629 217 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 DCTPP1Q9H773 170 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 ABCC6O95255 1503 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-209ENST00000428120 DDRGK1Q96HY6 314 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A6Q13433 755 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 APBB1O00213 710 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 CYP27B1O15528 508 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 GNAI2P04899 355 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A3P48751 1232 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-209ENST00000428120 PROSER3Q2NL68 480 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF790Q6PG37 636 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 GNAI3P08754 354 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 STRN4Q9NRL3 753 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 USP44Q9H0E7 712 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 ABCA3Q99758 1704 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 HMMRO75330 724 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF5Q96JK2 942 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-209ENST00000428120 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY9O60503 1353 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 BEND3Q5T5X7 828 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 EVA1CP58658 441 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 CABP4P57796 275 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 ATP8B2P98198 1209 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 USP35Q9P2H5 1018 aa28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms