RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 TEFQ10587 303 aa26.77■■□□□ 1.88
TSTA3-201ENST00000425753 PAPPAQ13219 1627 aa26.76■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.75■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 WWC1Q8IX03 1113 aa26.73■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 PLSCR1O15162 318 aa26.72■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF521Q96K83 1311 aa26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 APBA3O96018 575 aa26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 ATG3Q9NT62 314 aa26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.71■■□□□ 1.87
TSTA3-201ENST00000425753 PALLDQ8WX93 1383 aa26.69■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.69■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 BAG6P46379 1132 aa26.68■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 LY75O60449 1722 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 IL16Q14005 1332 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 BTBD11A6QL63 1104 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 WDR63Q8IWG1 891 aa26.67■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF853P0CG23 659 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF790Q6PG37 636 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 CFAP44Q96MT7 982 aa26.66■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.65■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 IFT57Q9NWB7 429 aa26.65■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.65■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 CHL1O00533 1208 aa26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TSTA3-201ENST00000425753 SLC39A6Q13433 755 aa26.63■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.62■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 GNAI1P63096 354 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 PROM2Q8N271 834 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 RREB1Q92766 1687 aa26.61■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.6■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 KCNQ3O43525 872 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 SIK1P57059 783 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 TXNRD1Q16881 649 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.59■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.58■■□□□ 1.85
TSTA3-201ENST00000425753 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.58■■□□□ 1.85
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TSTA3-201ENST00000425753 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
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TSTA3-201ENST00000425753 MBIPQ9NS73 344 aa26.57■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.56■■□□□ 1.84
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TSTA3-201ENST00000425753 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.56■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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TSTA3-201ENST00000425753 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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TSTA3-201ENST00000425753 TJP1Q07157 1748 aa26.54■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 C5P01031 1676 aa26.53■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.52■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 ATP6V1AP38606 617 aa26.52■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 ITPK1Q13572 414 aa26.52■■□□□ 1.84
TSTA3-201ENST00000425753 E9PSI1 815 aa26.51■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.51■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.5■■□□□ 1.83
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TSTA3-201ENST00000425753 SLFN5Q08AF3 891 aa26.49■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.49■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 KCNQ4P56696 695 aa26.47■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.47■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 HOXB7P09629 217 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 C4BP0C0L5 1744 aa26.46■■□□□ 1.83
TSTA3-201ENST00000425753 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.45■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.43■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 KRT24Q2M2I5 525 aa26.43■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 AKT1S1Q96B36 256 aa26.43■■□□□ 1.82
TSTA3-201ENST00000425753 STARD3NLO95772 234 aa26.42■■□□□ 1.82
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