RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDRP35968 1356 aa18.18■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNPATO15228 680 aa18.18■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1AP38606 617 aa18.18■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.18■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG3Q9NT62 314 aa18.16■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.15■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.15■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.15■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.14■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP350Q5VT06 3117 aa18.14■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.12■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP10P09238 476 aa18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF5Q96JK2 942 aa18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4AP0C0L4 1744 aa18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.1■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.09■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.09■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PANK3Q9H999 370 aa18.08■□□□□ 0.49
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.07■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABP4P57796 275 aa18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFB2P61812 414 aa18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TJP1Q07157 1748 aa18.06■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.05■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KA4O75676 772 aa18.04■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GYS1P13807 737 aa18.04■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFC4P35249 363 aa18.04■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.04■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.04■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA6P17066 643 aa18.03■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTHFSP49914 203 aa18.03■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORC1Q86VD1 984 aa18.03■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.03■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCS1LQ9Y276 419 aa18.02■□□□□ 0.48
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JLW4 131 aa18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF3CO14782 793 aa18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.01■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPEP1P16444 411 aa18■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.99■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRKLP46109 303 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCHSD2O94868 740 aa17.98■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL13P35225 146 aa17.98■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.98■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRC1P22897 1456 aa17.97■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.96■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.96■□□□□ 0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP8Q14318 412 aa17.95■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.95■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNA3P22001 575 aa17.95■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDR1Q08345 913 aa17.95■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFFO2Q5TF58 517 aa17.95■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.93■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIM2Q9P1W9 311 aa17.93■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.92■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM70O94826 608 aa17.92■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.92■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMRK2Q9NPI5 230 aa17.91■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGR6Q9HBX8 967 aa17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRXN2Q9P2S2 1712 aa17.9■□□□□ 0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZPR1O75312 459 aa17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms