RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420309.5

PCBP1-AS1-216, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TMC2Q8TDI7 906 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GOLGA1Q92805 767 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C8orf48Q96LL4 319 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 POGKQ9P215 609 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.86□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KIF5CO60282 957 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 VAMP4O75379 141 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LDHCP07864 332 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TCEAL1Q15170 157 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 VPS72Q15906 364 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.85□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 AKNAQ7Z591 1439 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NPHP1O15259 732 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 UQCRHP07919 91 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 AMHR2Q16671 573 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CTR9Q6PD62 1173 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GLMNQ92990 594 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BORCS6Q96GS4 357 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 EFCC1Q9HA90 598 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.84□□□□□ -1.31
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KIF3CO14782 793 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MTA2O94776 668 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SETSIPP0DME0 302 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ATP2B1P20020 1258 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CASP2P42575 452 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TMED1Q13445 227 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC184Q52MB2 194 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MUC3BQ9H195 1237 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TMX1Q9H3N1 280 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SUN2Q9UH99 717 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KLF15Q9UIH9 416 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LZTS1Q9Y250 596 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KIF3AQ9Y496 699 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.83□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZMYM3Q14202 1370 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CUX1P39880 1505 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IFT140Q96RY7 1462 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 16.4
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC159P0C7I6 412 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SOGA3Q5TF21 947 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC89Q8N998 374 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MNS1Q8NEH6 495 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 JDP2Q8WYK2 163 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TSPY26PQ9H489 355 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.82□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TOP2BQ02880 1626 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 VGLL3A8MV65 326 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC175P0C221 793 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FAM163BP0C2L3 166 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF853P0CG23 659 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DSG3P32926 999 aa6.81□□□□□ -1.32
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IFT88Q13099 833 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms