RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 FBLN1P23142 703 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 AK7Q96M32 723 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRC-206ENST00000413409 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 HOXC9P31274 260 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF4Q96M43 638 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 BCS1LQ9Y276 419 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 FSTL1Q12841 308 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0G2JLW4 131 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRC-206ENST00000413409 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 SSFA2P28290 1259 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 MMP10P09238 476 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1W2PP64 1363 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 AMPHP49418 695 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 TGFB2P61812 414 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 CYP27B1O15528 508 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 PIGBQ92521 554 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 SLC34A2O95436 690 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 DPEP1P16444 411 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 MORC1Q86VD1 984 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 RRAGCQ9HB90 399 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-206ENST00000413409 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 FCHSD2O94868 740 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 ITGB4P16144 1822 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 GNPATO15228 680 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 KCNA3P22001 575 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 ITPK1Q13572 414 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 SIK1P57059 783 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 NGEFQ8N5V2 710 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 COG3Q96JB2 828 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRC-206ENST00000413409 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 RNF181Q9P0P0 153 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF521Q96K83 1311 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 RTL1A6NKG5 1358 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 ATP6V1AP38606 617 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 DCAF5Q96JK2 942 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 CFAP53Q96M91 514 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRC-206ENST00000413409 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 C4AP0C0L4 1744 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 GYS1P13807 737 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 PIM2Q9P1W9 311 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 ATG3Q9NT62 314 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 SBF1O95248 1867 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 MTHFSP49914 203 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 FYB1O15117 783 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms