RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CBLBQ13191 982 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZVU0 165 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 TNS4Q8IZW8 715 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SERTAD1Q9UHV2 236 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 IL2RAP01589 272 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 TIMP2P16035 220 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SMPD1P17405 629 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 IGFBP4P22692 258 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SCNN1AP37088 669 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.2
PTPRC-205ENST00000391970 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 RGS20O76081 388 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SERPINB4P48594 390 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 FOXK2Q01167 660 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 CLN3Q13286 438 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 MTFR1Q15390 333 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 XAGE2Q96GT9 111 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 MTMR7Q9Y216 660 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PRU2 124 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 A6NJY4 79 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 FOXO3O43524 673 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 C21orf2O43822 256 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PTGIRP43119 386 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SMTNP53814 917 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 MEIOBQ8N635 442 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 CNKSR1Q969H4 720 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 TLR1Q15399 786 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 HPS1Q92902 700 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 COL26A1Q96A83 441 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 RELBQ01201 579 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 SEPT3Q9UH03 358 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 USP3Q9Y6I4 520 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 MEN1O00255 615 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CDK2AP1O14519 115 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CENPCQ03188 943 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC27Q2M243 656 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 TBCELQ5QJ74 424 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF15Q8N660 670 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ABL1P00519 1130 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 POTEAQ6S8J7 498 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 RGS22Q8NE09 1264 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP3Q96P20 1036 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 H3BRB1 525 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 GFRA3O60609 400 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ICMTO60725 284 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 EML1O00423 815 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 SPINT1O43278 529 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 GPC1P35052 558 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 TEAD4Q15561 434 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 HELQQ8TDG4 1101 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-205ENST00000391970 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.47□□□□□ -1.53
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