RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 PHF14O94880 888 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 KDRP35968 1356 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.97■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 IL13P35225 146 aa23.96■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 ITPK1Q13572 414 aa23.96■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.96■■□□□ 1.43
SYP-202ENST00000376303 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 MTHFSP49914 203 aa23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 CABP4P57796 275 aa23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.94■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 GNPATO15228 680 aa23.93■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 SMIM5Q71RC9 77 aa23.92■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.91■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 GRIN3BO60391 1043 aa23.9■■□□□ 1.42
SYP-202ENST00000376303 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.89■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.87■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.86■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.86■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.86■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.85■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 ADRA2BP18089 450 aa23.84■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 HMOX1P09601 288 aa23.83■■□□□ 1.41
SYP-202ENST00000376303 RPS6KA4O75676 772 aa23.81■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.81■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.8■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 MMP10P09238 476 aa23.79■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 RFC4P35249 363 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 LGR6Q9HBX8 967 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 C4AP0C0L4 1744 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 TJP1Q07157 1748 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 MRC1P22897 1456 aa23.77■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SYP-202ENST00000376303 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.76■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 GYS1P13807 737 aa23.75■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 TGFB2P61812 414 aa23.71■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
SYP-202ENST00000376303 SLC39A6Q13433 755 aa23.7■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.7■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.7■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.7■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.69■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.69■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 C1QTNF8P60827 252 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.67■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 CFAP53Q96M91 514 aa23.67■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.65■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SYP-202ENST00000376303 FKBP8Q14318 412 aa23.64■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ATP10DQ9P241 1426 aa23.64■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 A0A0G2JLW4 131 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ZPR1O75312 459 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 TEFQ10587 303 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ADCY9O60503 1353 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 IL17REQ8NFR9 667 aa23.62■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 NUDCQ9Y266 331 aa23.62■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 BCS1LQ9Y276 419 aa23.61■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 DPEP1P16444 411 aa23.6■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.6■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.6■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 PPP2R1AP30153 589 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 TM4SF1P30408 202 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-202ENST00000376303 PRKAR2BP31323 418 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms