RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYDQ12882 1025 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 XAGE2Q96GT9 111 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 UPP2O95045 317 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 IL2RAP01589 272 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 INHAP05111 366 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CLN3Q13286 438 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SFI1A8K8P3 1242 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINT1O43278 529 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP2P12643 396 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC13P55735 322 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SCARF1Q14162 830 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CNKSR1Q969H4 720 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF358Q9NW07 568 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MEN1O00255 615 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 VEGFBP49765 207 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 STK32AQ8WU08 396 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP3Q96P20 1036 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R2N6 131 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 GMPRP36959 345 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPCQ03188 943 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP42Q96MM3 310 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 BACH1O14867 736 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SMTNP53814 917 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RETREG2Q8NC44 543 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 GPC1P35052 558 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TNS4Q8IZW8 715 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF7Q92985 503 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-202ENST00000370826 A6NJY4 79 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHA4P54764 986 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 MTFR1Q15390 333 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TLR1Q15399 786 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 HINFPQ9BQA5 517 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CARNS1A5YM72 827 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL8A6PVC2 850 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LGR5O75473 907 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF217Q8TC41 542 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK2AP1O14519 115 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 USTQ9Y2C2 406 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXK2Q01167 660 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SLAIN2Q9P270 581 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 USP3Q9Y6I4 520 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BM21 787 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE4CQ08493 712 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TBCELQ5QJ74 424 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ERBB4Q15303 1308 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 C21orf2O43822 256 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 WEE1P30291 646 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 POU4F2Q12837 409 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-202ENST00000370826 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-202ENST00000370826 SOBPA7XYQ1 873 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT3O60678 531 aa7.33□□□□□ -1.24
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