RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35F4A4IF30 521 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASA1P20936 1047 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNASQ5JWF2 1037 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC102BQ68D86 513 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TREML4Q6UXN2 200 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIX5Q8N196 739 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF15Q8N660 670 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF358Q9NW07 568 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 BACH1O14867 736 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFX1P22670 979 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMTNP53814 917 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF7Q92985 503 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NJY4 79 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM196BA6NMK8 535 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L15C9J2P7 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L10C9JJH3 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L12C9JPN9 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L11C9JVI0 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L21D6R901 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L18D6R9N7 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L22D6RA61 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L19D6RCP7 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L20D6RJB6 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA6P23229 1130 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHKA2P46019 1235 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP17L24Q0WX57 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTFR1Q15390 333 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR44Q5JSH3 913 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf17Q53FE4 359 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC14CA4D256 554 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSIG8P0DPA2 414 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G4AP47712 749 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTK7Q13308 1070 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE2CQ5TA81 110 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERBB4Q15303 1308 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GTH6 734 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFI1A8K8P3 1242 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R2N6 131 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK2AP1O14519 115 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DKK1O94907 266 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHA4P54764 986 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC13P55735 322 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNS4Q8IZW8 715 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPAMQ9HCL2 828 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP3Q9Y6I4 520 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPYDQ12882 1025 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCA8Q53HL2 280 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 CABP1Q9NZU7 370 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-552P-201ENST00000362869 F11P03951 625 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXK2Q01167 660 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C1W4 665 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMPRP36959 345 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBCELQ5QJ74 424 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 SV2AQ7L0J3 742 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms