RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 EYA1Q99502 592 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 GNAI3P08754 354 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 ESPNB1AK53 854 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 EID1Q9Y6B2 187 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 MCTP1Q6DN14 999 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 FLIIQ13045 1269 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 NWD1Q149M9 1564 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF445P59923 1031 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 MX1P20591 662 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 PKP1Q13835 747 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 TBX22Q9Y458 520 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K5Q99683 1374 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 MCM2P49736 904 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ERBB4Q15303 1308 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 MCCP23508 829 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ATP8B2P98198 1209 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ANAPC15P60006 121 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 STAP2Q9UGK3 403 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 AOX1Q06278 1338 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS3-201ENST00000355530 HOXC9P31274 260 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 NEK4P51957 841 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 NLRP6P59044 892 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 CHMLP26374 656 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 TMX3Q96JJ7 454 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 IL17RAQ96F46 866 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 CUL4AQ13619 759 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 IL17REQ8NFR9 667 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 LTN1O94822 1766 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 NECTIN2Q92692 538 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 RILPL2Q969X0 211 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 USP44Q9H0E7 712 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 GPT2Q8TD30 523 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS3-201ENST00000355530 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 SSH3Q8TE77 659 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 PALD1Q9ULE6 856 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 RAB11FIP3O75154 756 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 BRD1O95696 1058 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 MBD3O95983 291 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 POLA2Q14181 598 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 HS1BP3Q53T59 392 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 ABTB2Q8N961 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 RBSNQ9H1K0 784 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS3-201ENST00000355530 HOXB7P09629 217 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA4P34932 840 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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