RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 TRPM2O94759 1503 aa18.53■□□□□ 0.56
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PTPRU-201ENST00000345512 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 PREX2Q70Z35 1606 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 SDF4Q9BRK5 362 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ZFYVE9O95405 1425 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 MCM5P33992 734 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 CPLX1O14810 134 aa18.52■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 RBSNQ9H1K0 784 aa18.52■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 IL13P35225 146 aa18.51■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 ZMYND15Q9H091 742 aa18.49■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 FOXO3O43524 673 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 BTBD11A6QL63 1104 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.48■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 G2E3Q7L622 706 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 ATP8B2P98198 1209 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.46■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRU-201ENST00000345512 HS1BP3Q53T59 392 aa18.46■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.46■□□□□ 0.55
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF445P59923 1031 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PKP1Q13835 747 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2HP62256 183 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CHMLP26374 656 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 DDX11Q96FC9 970 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 MYOM2P54296 1465 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ANXA1P04083 346 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.44■□□□□ 0.54
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PTPRU-201ENST00000345512 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 APPP05067 770 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 WASHC4Q2M389 1173 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 DYNC1I1O14576 645 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 UVSSAQ2YD98 709 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 CHL1O00533 1208 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 NPHP1O15259 732 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRU-201ENST00000345512 ME1P48163 572 aa18.42■□□□□ 0.54
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