RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SPG7Q9UQ90 795 aa7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS2O95450 1211 aa7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 IGSF3O75054 1194 aa7.76□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 LGR6Q9HBX8 967 aa7.76□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.76□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PLCB2Q00722 1185 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 IL2RBP14784 551 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PHKG2P15735 406 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TSPYL6Q8N831 410 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SLIT2O94813 1529 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 VAMP4O75379 141 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ZNF428Q96B54 188 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.75□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 DISP2A7MBM2 1401 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 HSPA1LP34931 641 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 MRC1P22897 1456 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 LRP6O75581 1613 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 CYP27B1O15528 508 aa7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TEFQ10587 303 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 USP35Q9P2H5 1018 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 KRT24Q2M2I5 525 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ARID3AQ99856 593 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 IL27Q8NEV9 243 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 CRBNQ96SW2 442 aa7.73□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 DCAF5Q96JK2 942 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 BTBD11A6QL63 1104 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 CNPY4Q8N129 248 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 PDE3AQ14432 1141 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.72□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 KIF16BQ96L93 1317 aa7.71□□□□□ -1.17
CCR6-201ENST00000341935 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 C8orf37Q96NL8 207 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 PAPPAQ13219 1627 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.71□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 NGLY1Q96IV0 654 aa7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TNNQ9UQP3 1299 aa7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 KCNQ3O43525 872 aa7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 PANK1Q8TE04 598 aa7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TNS2Q63HR2 1409 aa7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 MS4A1P11836 297 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 C5P01031 1676 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 RLBP1P12271 317 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 TRIM27P14373 513 aa7.69□□□□□ -1.18
CCR6-201ENST00000341935 CABP4P57796 275 aa7.69□□□□□ -1.18
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