RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331018.8

TTLL1-202, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-202ENST00000331018 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.26■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.25■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 SIK1P57059 783 aa16.25■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 SYT17Q9BSW7 474 aa16.25■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 MAP3K5Q99683 1374 aa16.25■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 C4BP0C0L5 1744 aa16.23■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.23■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 ITPK1Q13572 414 aa16.22■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 POLD1P28340 1107 aa16.21■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.21■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.21■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.21■□□□□ 0.19
TTLL1-202ENST00000331018 ATP6V1AP38606 617 aa16.2■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.2■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.2■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 NEFLP07196 543 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 HMOX1P09601 288 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 CABP4P57796 275 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 AK7Q96M32 723 aa16.19■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 SSFA2P28290 1259 aa16.18■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.18■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.18■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 SMIM5Q71RC9 77 aa16.16■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 LGR6Q9HBX8 967 aa16.16■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.15■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 MSL1Q68DK7 614 aa16.15■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTLL1-202ENST00000331018 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 PHF14O94880 888 aa16.14■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.14■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.14■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 GNPATO15228 680 aa16.13■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 PPP2R1AP30153 589 aa16.13■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 MRC1P22897 1456 aa16.13■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.13■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 YY1P25490 414 aa16.12■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.12■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 CFAP53Q96M91 514 aa16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 RPS6KA4O75676 772 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 KLHL34Q8N239 644 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.1■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.09■□□□□ 0.17
TTLL1-202ENST00000331018 UTRNP46939 3433 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 TJP1Q07157 1748 aa16.08■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 SLC39A6Q13433 755 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 IL17REQ8NFR9 667 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 NUDCQ9Y266 331 aa16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 GPR162Q16538 588 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 GYS1P13807 737 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 PRKAR2BP31323 418 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 FCHSD2O94868 740 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 MMP10P09238 476 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 RFC4P35249 363 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 FKBP8Q14318 412 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-202ENST00000331018 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-202ENST00000331018 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTLL1-202ENST00000331018 TEFQ10587 303 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL1-202ENST00000331018 C4AP0C0L4 1744 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL1-202ENST00000331018 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms