RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 ZNF853P0CG23 659 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 TEFQ10587 303 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 PAPPAQ13219 1627 aa28.55■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 GNAI1P63096 354 aa28.54■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 CFAP44Q96MT7 982 aa28.54■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 FAM182BQ5T319 152 aa28.53■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.53■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.53■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 MBIPQ9NS73 344 aa28.53■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.53■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
STX4-201ENST00000313843 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 CHL1O00533 1208 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 CABP4P57796 275 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 NHSQ6T4R5 1651 aa28.5■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.49■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.49■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 BCL9O00512 1426 aa28.48■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.47■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 BTBD11A6QL63 1104 aa28.46■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
STX4-201ENST00000313843 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.45■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 BTAF1O14981 1849 aa28.44■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 C5P01031 1676 aa28.43■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.43■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 KCNQ3O43525 872 aa28.42■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 SLC39A6Q13433 755 aa28.41■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 KRT24Q2M2I5 525 aa28.4■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 KCNQ2O43526 872 aa28.4■■■□□ 2.14
STX4-201ENST00000313843 PIGBQ92521 554 aa28.39■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 EP400Q96L91 3159 aa28.38■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 ZNF790Q6PG37 636 aa28.37■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 TSPYL6Q8N831 410 aa28.37■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.37■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.37■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 TRIM37O94972 964 aa28.35■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.34■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.33■■■□□ 2.13
STX4-201ENST00000313843 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.32■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 ATG3Q9NT62 314 aa28.31■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 TJP1Q07157 1748 aa28.3■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.29■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.29■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 LY75O60449 1722 aa28.28■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 VAMP4O75379 141 aa28.27■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.27■■■□□ 2.12
STX4-201ENST00000313843 CACNA1FO60840 1977 aa28.26■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.26■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 PALLDQ8WX93 1383 aa28.24■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.23■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 APBA3O96018 575 aa28.22■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.22■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 NECTIN2Q92692 538 aa28.21■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 HOXB7P09629 217 aa28.21■■■□□ 2.11
STX4-201ENST00000313843 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.19■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 BCAR3O75815 825 aa28.19■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 CCDC125Q86Z20 511 aa28.19■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.19■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.18■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 ZNF428Q96B54 188 aa28.18■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.18■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.17■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.16■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 SIK1P57059 783 aa28.16■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.16■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 PLSCR1O15162 318 aa28.15■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.15■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 USP16Q9Y5T5 823 aa28.15■■■□□ 2.1
STX4-201ENST00000313843 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.14■■■□□ 2.09
STX4-201ENST00000313843 ATP6V1AP38606 617 aa28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms