RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 ATP10DQ9P241 1426 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 PXDNQ92626 1479 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 NCAPD2Q15021 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 FLIIQ13045 1269 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.77■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.77■■□□□ 1.88
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MESP1-201ENST00000300057 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 CEP85Q6P2H3 762 aa26.76■■□□□ 1.87
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MESP1-201ENST00000300057 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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MESP1-201ENST00000300057 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.73■■□□□ 1.87
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MESP1-201ENST00000300057 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.64■■□□□ 1.85
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MESP1-201ENST00000300057 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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MESP1-201ENST00000300057 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.51■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 CDC45O75419 566 aa26.51■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 ATP8B2P98198 1209 aa26.51■■□□□ 1.83
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MESP1-201ENST00000300057 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.5■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC39A6Q13433 755 aa26.5■■□□□ 1.83
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