RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 ATP10DQ9P241 1426 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 PXDNQ92626 1479 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 NCAPD2Q15021 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 FLIIQ13045 1269 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.78■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.77■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.77■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 TEFQ10587 303 aa26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 CEP85Q6P2H3 762 aa26.76■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.75■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.75■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.75■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 ERBB3P21860 1342 aa26.75■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.75■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.74■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.73■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 DCTPP1Q9H773 170 aa26.73■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.73■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 KCNQ3O43525 872 aa26.72■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 BTBD11A6QL63 1104 aa26.71■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.71■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
MESP1-201ENST00000300057 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 CACNA1FO60840 1977 aa26.7■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.7■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.68■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.68■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 CHRNA2Q15822 529 aa26.66■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 APBB1O00213 710 aa26.66■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.65■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 STRCQ7RTU9 1775 aa26.65■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.65■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.65■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.65■■□□□ 1.86
MESP1-201ENST00000300057 GNAI2P04899 355 aa26.64■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.64■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.64■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.63■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 BRINP3Q76B58 766 aa26.63■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 COL18A1P39060 1754 aa26.63■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 HMMRO75330 724 aa26.63■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 HOXB7P09629 217 aa26.63■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.62■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.61■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 GNAI3P08754 354 aa26.61■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 BECN1Q14457 450 aa26.61■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.6■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 ANXA1P04083 346 aa26.6■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 MEGF6O75095 1541 aa26.58■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
MESP1-201ENST00000300057 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.56■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.55■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 USP44Q9H0E7 712 aa26.55■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.55■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 SPG7Q9UQ90 795 aa26.55■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.54■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 TTC22Q5TAA0 569 aa26.54■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.54■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.54■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 PHKG2P15735 406 aa26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 SLAIN2Q9P270 581 aa26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 CPDO75976 1380 aa26.52■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 ABCC6O95255 1503 aa26.52■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.51■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.51■■□□□ 1.84
MESP1-201ENST00000300057 CDC45O75419 566 aa26.51■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 ATP8B2P98198 1209 aa26.51■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.51■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 PROSER3Q2NL68 480 aa26.5■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.5■■□□□ 1.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC39A6Q13433 755 aa26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms